Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
E2F4Q16254 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms