Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
USF2Q15853 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
USF2Q15853 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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