Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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ALX1Q15699 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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ALX1Q15699 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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ALX1Q15699 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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ALX1Q15699 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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ALX1Q15699 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
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ALX1Q15699 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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ALX1Q15699 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALX1Q15699 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALX1Q15699 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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