Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SYCP1Q15431 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
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SYCP1Q15431 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SYCP1Q15431 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SYCP1Q15431 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SYCP1Q15431 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SYCP1Q15431 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SYCP1Q15431 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SYCP1Q15431 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYCP1Q15431 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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