Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SMC1AQ14683 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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