Protein–RNA interactions for Protein: Q13976

PRKG1, cGMP-dependent protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKG1Q13976 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PRKG1Q13976 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms