Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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ITGA9Q13797 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGA9Q13797 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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