Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RAPSNQ13702 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAPSNQ13702 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.7 ms