Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HDAC1Q13547 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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