Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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TOP3AQ13472 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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TOP3AQ13472 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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TOP3AQ13472 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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TOP3AQ13472 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TOP3AQ13472 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TOP3AQ13472 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TOP3AQ13472 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TOP3AQ13472 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TOP3AQ13472 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TOP3AQ13472 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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TOP3AQ13472 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TOP3AQ13472 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TOP3AQ13472 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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TOP3AQ13472 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TOP3AQ13472 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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