Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE3BQ13370 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE3BQ13370 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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