Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRIM28Q13263 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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