Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NR1H3Q13133 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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