Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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TRAF1Q13077 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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TRAF1Q13077 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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TRAF1Q13077 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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TRAF1Q13077 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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TRAF1Q13077 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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TRAF1Q13077 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF1Q13077 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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