Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SLC10A2Q12908 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SLC10A2Q12908 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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