Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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BPTFQ12830 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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BPTFQ12830 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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BPTFQ12830 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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BPTFQ12830 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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BPTFQ12830 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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BPTFQ12830 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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BPTFQ12830 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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BPTFQ12830 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
BPTFQ12830 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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BPTFQ12830 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
BPTFQ12830 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms