Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SMARCB1Q12824 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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