Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
TWF1Q12792 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms