Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms