Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SCAPQ12770 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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