Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZGT2

NEXN, Nexilin, humanhuman

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEXNQ0ZGT2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NEXNQ0ZGT2 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NEXNQ0ZGT2 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms