Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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