Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
RIPPLY1Q0D2K3 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms