Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NIPAL4Q0D2K0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms