Protein–RNA interactions for Protein: Q08AF3

SLFN5, Schlafen family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 891 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLFN5Q08AF3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SLFN5Q08AF3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SLFN5Q08AF3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms