Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CYP4F3Q08477 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms