Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SOX4Q06945 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SOX4Q06945 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms