Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FMODQ06828 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FMODQ06828 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FMODQ06828 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FMODQ06828 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FMODQ06828 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FMODQ06828 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
FMODQ06828 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FMODQ06828 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FMODQ06828 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FMODQ06828 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FMODQ06828 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FMODQ06828 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FMODQ06828 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FMODQ06828 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FMODQ06828 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FMODQ06828 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FMODQ06828 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FMODQ06828 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FMODQ06828 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FMODQ06828 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
FMODQ06828 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FMODQ06828 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FMODQ06828 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FMODQ06828 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FMODQ06828 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FMODQ06828 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FMODQ06828 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FMODQ06828 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FMODQ06828 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FMODQ06828 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
FMODQ06828 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms