Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RELAQ04206 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RELAQ04206 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RELAQ04206 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RELAQ04206 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RELAQ04206 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RELAQ04206 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RELAQ04206 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RELAQ04206 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RELAQ04206 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RELAQ04206 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RELAQ04206 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RELAQ04206 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RELAQ04206 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RELAQ04206 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RELAQ04206 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RELAQ04206 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RELAQ04206 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RELAQ04206 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RELAQ04206 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RELAQ04206 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RELAQ04206 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RELAQ04206 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RELAQ04206 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RELAQ04206 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RELAQ04206 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RELAQ04206 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RELAQ04206 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms