Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CREMQ03060 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CREMQ03060 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CREMQ03060 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREMQ03060 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREMQ03060 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREMQ03060 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREMQ03060 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREMQ03060 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREMQ03060 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREMQ03060 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREMQ03060 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CREMQ03060 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREMQ03060 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREMQ03060 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREMQ03060 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREMQ03060 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREMQ03060 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREMQ03060 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREMQ03060 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREMQ03060 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREMQ03060 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREMQ03060 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CREMQ03060 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms