Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NRG1Q02297 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms