Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BNC1Q01954 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms