Protein–RNA interactions for Protein: P98161

PKD1, Polycystin-1, humanhuman

Predictions only

Length 4,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD1P98161 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
PKD1P98161 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKD1P98161 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKD1P98161 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKD1P98161 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PKD1P98161 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKD1P98161 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKD1P98161 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKD1P98161 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKD1P98161 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKD1P98161 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKD1P98161 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKD1P98161 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
PKD1P98161 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
PKD1P98161 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms