Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SKP1P63208 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SKP1P63208 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SKP1P63208 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms