Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GJA9P57773 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GJA9P57773 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GJA9P57773 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms