Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SNX16P57768 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SNX16P57768 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX16P57768 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX16P57768 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX16P57768 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX16P57768 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX16P57768 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX16P57768 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX16P57768 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX16P57768 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX16P57768 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX16P57768 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX16P57768 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SNX16P57768 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms