Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UBASH3AP57075 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.6 ms