Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 LINC01551-203ENST00000550266 455 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SEC13P55735 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SEC13P55735 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SEC13P55735 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms