Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAD23BP54727 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms