Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCT3P49368 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCT3P49368 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCT3P49368 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCT3P49368 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCT3P49368 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCT3P49368 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCT3P49368 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms