Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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APOBEC1P41238 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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APOBEC1P41238 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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APOBEC1P41238 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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APOBEC1P41238 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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APOBEC1P41238 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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APOBEC1P41238 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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APOBEC1P41238 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
APOBEC1P41238 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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