Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
FDFT1P37268 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms