Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HOXD12P35452 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HOXD12P35452 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms