Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASP1P29466 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASP1P29466 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CASP1P29466 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms