Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GCAP28676 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GCAP28676 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCAP28676 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCAP28676 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCAP28676 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCAP28676 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCAP28676 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCAP28676 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCAP28676 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GCAP28676 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCAP28676 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCAP28676 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCAP28676 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GCAP28676 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
GCAP28676 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GCAP28676 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms