Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NMBRP28336 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NMBRP28336 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NMBRP28336 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms