Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SSFA2P28290 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms