Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PTPRDP23468 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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