Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLDCP23378 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLDCP23378 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLDCP23378 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLDCP23378 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLDCP23378 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLDCP23378 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GLDCP23378 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLDCP23378 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLDCP23378 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GLDCP23378 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLDCP23378 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GLDCP23378 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GLDCP23378 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GLDCP23378 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms