Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
LHCGRP22888 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
LHCGRP22888 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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